有機肥發酵罐主要應用與雞糞豬糞的發酵，同時也可以發酵污泥，廚余垃圾，等其他畜禽糞便的發酵（因為雞糞和豬糞氮磷鉀的含量比較高，發酵出來的肥料比較好所以主要發酵物是雞糞和豬糞，其他發酵物在發酵之前通常還要經過一定處理才可發酵），有機肥發酵罐主要解決問題是養殖行業糞便排污的問題，改變了傳統的槽式發酵，與槽式發酵比較有以下幾大優點：
1、占地面積小，以每日糞污處理量10噸來計算，槽式發酵需要800平，而立式有機肥發酵罐只需要60平
2、處理程度高，相比較槽式發酵來說，立式有機肥發酵罐配備除臭系統噴淋系統，有效解決氣味問題和糞污滲透液問題，傳統槽式發酵由于是露天發酵，氣味排放到大氣污染大氣環境，在由于糞污濕度通常在70%以上會產生滲濾液污染地下水，所以現在很多地域禁止露天反拋發酵。
3、處理效率高，發酵有機肥要投入復合菌種，菌種是好氧菌并在60度達到佳生長溫度，槽式發酵無法控制溫度，而立式發酵罐在攪拌葉上均勻分布曝氣孔，同時罐內溫度是恒溫，給菌種創造更好地發酵環境。這就是相比現在傳統的槽式發酵的幾大優點。
立式好氧發酵罐采用好氧微生物有氧發酵原理，使微生物利用污泥中的有機質、殘留蛋白等，在一定溫度、濕度和充足氧氣環境狀態下，快速繁殖。繁殖過程中，它們消耗糞便中的有機質、蛋白和氧氣，代謝產生氨氣、CO2和水蒸氣。同時釋放大量的熱量，使罐內溫度升高。在45℃~70℃進一步促進微生物生長代謝，同時60℃以上的溫度可殺滅糞便中的有害細菌和病原體、寄生蟲卵等有害物質，同時平衡有益菌存活的溫度、濕度和PH值，滿足有益菌生存條件，隨著新鮮有機廢棄物不斷加入，罐內微生物循環持續繁殖，從而實現對污泥的無害化處理。
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